Çalışma süresi Hesabı ve Yıllık İzin?

Merhaba...
Taşeron şirket elemanı olarak hastanede kayıt elemanı olarak çalışan kişi; günlük 9,5 saat (30 dakikası yemek molası ara dinlenme hakkı verilmiyor net 9 saat çalışıyor) çalışma süresi ile 5 günde haftalık 45 saat çalışma süresini tamamlayarak çalışıyor ve cumartesi pazar işe gitmiyor. Bu kişi pazartesi gününden itibaren 5 gün yıllık izin aldığında izin dönüşü işe başlama tarihi 6. gün olan cumartesi midir yoksa 45 saati tamamladığı için bir sonraki pazartesi midir?
Hastanenin uygulaması ise şöyle; 5 gün yıllık izin veriyor, cumartesi günü işe çağırmıyor ama özlük dosyasına 6 gün izin yapmıştır şeklinde kaydediyor?
Yaptıkları bu uygulamaya İş Kanununun 46 ve 54. maddelerini dayanak gösteriyor!

Ayrıca 3-5 günlük raporlarda bunun 2 gününü işçinin ücretinden kesiyor kişi maaşını 2 gün eksik olarak alıyor?

Bunlar doğru hesaplamalar mıdır? Kişi hakkını nasıl arayabilir?

Teşekkürler...